大蒜的主要病害有叶枯病、紫斑病、疫病、细菌性软腐病、病毒病、锈病等；主要害虫有葱地种蝇、蓟马、蚜虫、潜叶蝇、蛴螬、蝼蛄、地老虎等，尤其是多年连作、重茬种植的蒜田，病虫害为害严重。生产上大多使用化学农药进行常规防治，由于农药品种单一，用药量大，喷药次数多，造成病虫抗药性增强和大蒜农药残留超标，影响大蒜产品质量与食用安全，同时，过多使用化学农药使生态环境受到破坏，弊端很多。为此，在大蒜种植中要大力推广和采用绿色防控技术，以农业防治，物理、生物防治等综防措施，提高防效，减少化学农药的使用，促进大蒜增产增收。

大蒜病虫害绿色防控技术为：

一、农业防治：一是合理轮作。主要与水稻水旱轮作，改变大蒜病虫的生存环境条件，可以有效防止大蒜病害发生（尤其是土传病害）和地下害虫的为害。二是选用良种。主要选用生长势强、蒜株粗壮、蒜头肥大、质优高产、抗病性强的邳州白蒜、苍山蒲棵蒜等优良品种。三是种子处理。用60%吡虫啉悬浮种衣剂50毫升、50%多菌灵可湿性粉剂250克配成混合液拌浸泡好的蒜种100—150公斤，在阴凉处晾干即可播种。四是健身栽培。前茬收获后立即抢茬耕翻，晒垡晒透，争取晒15天以上，达到熟化土壤、减少土壤残留病虫数量，每亩施腐熟的有机肥3000—4000公斤、生物菌肥2公斤，氮磷钾三元复合肥30公斤。全生长期采用地膜覆盖栽培方式，减少土壤中病残体上的病原物借雨水、浇水与畦灌传播的机会，并提高土温、保墒节水，减少灌水次数，有一定的防病作用。五是清理田园。大蒜生长期与收获后及时拔除清理病株、病叶，带出田外集中销毁。

二、物理防治：主要利用色板诱杀，色板长25厘米、宽20厘米，每亩20—25块。蒜田悬挂蓝色粘虫板，诱杀蓟马、种蝇等害虫；悬挂黄色粘虫板，诱杀潜叶蝇、蚜虫等害虫。悬挂高度为板下沿距大蒜顶部10—25厘米，随大蒜生长及时调整色板高度，一般20—30天更换一次，以保证粘虫效果。

三、生物防治：用0.5%苦参碱水剂500倍液防治蓟马、潜叶蝇、蚜虫。用2%多抗霉素可湿性粉剂800—1000倍液防治紫斑病；用72%农用硫酸链霉素可溶性粉剂1500倍防治细菌软腐病；用1%香菇多糖水剂200—300倍液或8%宁南霉素水剂300—500倍液防治病毒病。

四、化学防治：必须使用高效、安全、低毒、低残留、对环境友好型化学农药防治病虫，而且一种农药在大蒜的一生中只能使用一次。一是用辛硫磷防治地下害虫。每亩用40%辛硫磷乳油500毫升，加水2公斤拌细土25公斤，匀撒地表，随即翻入土中，可防治葱地种蝇幼虫、蛴螬、蝼蛄、地老虎等地下害虫。二是用25%吡蚜酮可湿性粉剂2500倍防治蓟马、潜叶蝇、蚜虫等。三是用10%吡虫啉可湿性粉剂1500倍液防治葱地种蝇成虫，幼虫可用吡虫啉500倍液对准蒜株茎部喷浇，或拌毒土撒施。四是每亩用30%苯甲·丙环唑悬浮剂400毫升或25%咪鲜胺100毫升喷雾，防治叶枯病、紫斑病。五是每亩用20%噻唑锌悬浮剂80—120毫升或噻菌铜悬浮剂90—120毫升喷雾防治细菌性软腐病等。此外，可使用霜脲·锰锌粉剂防治疫病；三唑酮、代森锰锌混合防治锈病。以上化学药剂都应在农业防治、物理防治、生物防治等措施采用后，该病虫仍严重发生，才能使用。