根据科技部《关于下达2008-2009年国家星火计划项目的通知》（国科发计〔2008〕658号）的精神，我校杜光波副教授主持的《夏季猪病高发的病因调查与综合防控的研究》（项目编号为：2008GA690207）、朱尧生副教授主持的《猪蓝耳病（PRRS）快速诊断试纸的研究》（项目编号为：2008GA690208）、任淑年副教授主持的《彩色苗木产业开发》（项目编号为：2008GA690209）共三个项目获得立项，这是淮安生物工程分院科技项目取得的最高等级立项。

近年来，学校十分重视教科研工作，产学研结合取得了丰硕成果。仅2008年一年，学校就有2个教育科学研究课题获江苏省教育科学“十一五”规划课题立项，2个教育科学研究课题获江苏联合职业技术学院立项，13个教育科学研究课题获淮安市教育局立项。3个科研项目获国家科技部立项，1个科研研项目获省科技厅、农林厅立项，7个科技项目获淮安市科技局立项，另有2个横向课题分别与淮安奶牛场、淮安市楚州区兽医站联合成功，共获科研经费近100万元。