各省、自治区、直辖市及计划单列市农业（农林、农牧）、农机、畜牧、兽医、农垦、乡镇企业、渔业厅（局、委、办），部机关各司局、各直属单位：
　　农业财政专项资金是发展农业和农村经济的重要手段，为促进农业和农村经济的持续健康快速发展，实现农业和农村经济的“三增”目标起到了十分重要的作用。但是，近年来在审计和专项检查中发现，专项资金的使用管理存在挤占、滞留，预算执行不严和会计核算不规范等问题，这些问题如不及时加以纠正，将会极大地影响农业财政专项资金的使用效果。为贯彻落实《财政部关于进一步加强中央农口部门预算项目支出管理的通知》（财农[2006]37号）精神，充分发挥专项资金在建设社会主义新农村中的重要作用，确保财政资金使用的安全性、规范性和有效性，现就加强农业财政专项资金管理的有关问题通知如下：
　　一、加强专项资金的预算编制管理。预算编制是专项资金管理的首要环节。项目主管部门和项目单位要认真做好专项资金的预算编制工作，做到项目所涉及的技术路线、工作方法切实可行，项目实施内容细化，安排的工作量实事求是，项目经费预算真实可靠、科学合理。专项资金预算一经批复，项目单位必须认真执行，不得自行调整。因特殊原因确需调整的，应按原申报程序履行报批手续。
　　二、要对专项资金实行专账管理。项目单位要按照项目名称设置项目明细账，实行专账核算。由会计核算中心进行核算的，项目单位应设置项目辅助账。同一项目名称、执行不同内容的项目，要按照不同项目内容分别设置项目明细账或项目辅助明细账。
　　三、严禁滞留、截留项目资金。项目主管部门在收到上级部门或同级财政部门拨付的专项资金后，要及时将项目资金足额拨付到项目单位，不得以任何方式滞留、截留项目资金，资金在主管部门存放时间不得超过两个月。
　　四、严禁挤占挪用项目资金。项目单位要按照专款专用的原则使用项目资金，不准用于机构、人员经费开支，不准用于基本建设等支出。项目单位事业经费（或经营资金）与专项资金存于一个银行账户的，货币资金结存量不得低于项目资金的实际余额。
　　五、严禁计提项目管理费或奖励性支出。项目单位要本着节约、合理、有效的原则，严格按照批复的预算以及各项目管理办法规定的范围和标准使用专项资金，严禁以各种名义计提项目管理费或奖励性支出。
　　六、加强项目结余资金的控制与管理。项目单位要按照预算批复的要求，积极组织项目实施，加快项目执行进度。对已经执行但当年尚未完成的项目以及因故当年未执行的项目所形成的专项结余资金，要按照预算管理的要求，纳入下一年预算；对于当年已完成的项目和执行中途撤消的项目形成的净结余资金，不得随意处置。部属单位应在部门预算“二上”前将净结余资金结存情况报财务司审核，财务司在安排下年度预算时将统筹安排这部分资金；地方项目单位应在每年年初将这部分资金使用意见报省级主管部门审核汇总，省级主管部门于1月底前报我部审核批准后方可使用。
　　七、严格执行各项财务管理制度。项目单位要严格按照《会计法》、《现金管理暂行条例》等法律法规及各项财务管理制度的要求，建立健全内部管理制度，规范日常核算和支出管理，加强财务控制。对项目支出的原始凭证要严格审核，严禁白条入账和大额现金结算。
　　八、积极推进项目绩效评价。项目主管部门对项目的执行过程要实施全程监督管理，并对项目完成结果进行绩效评价。为增强政府支出的透明度，要建立绩效评价信息的公开发布制度，将绩效评价结果在一定范围内公布。
　　九、做好专项预算执行情况的总结分析工作。项目主管部门和项目单位要建立专项资金使用管理情况的总结分析制度，对项目执行情况和专项资金使用情况，定期进行总结分析。省级项目主管部门应于每年2月底前将本省（区、市）总结分析报告上报农业部；部直属单位应于每年2月底前将总结分析报告上报各主管司局。